Sejarah Madrasah Aliyah Negeri 3 Aceh Besar (MAN 3 Aceh Besar) berawal dari sebuah lembaga pendidikan swasta di Indrapuri, Aceh Besar, yang didirikan jauh sebelum masa kemerdekaan Indonesia.

1. Masa Awal (MAS Indrapuri)

Madrasah ini didirikan pada tanggal 1 Juli 1928 oleh Yayasan Tgk. H. Ahmad Hasballah Indrapuri, dan awalnya dikenal dengan nama Madrasah Aliyah Swasta (MAS) Indrapuri. Secara administratif, madrasah ini berlokasi di Jalan Kuburan Tgk. Cik Ditiro, Desa Pasar Indrapuri, Kecamatan Indrapuri, Kabupaten Aceh Besar, Propinsi Daerah Istimewa Aceh.

Pada tanggal 17 Januari 1991, MAS Indrapuri memperoleh Piagam Madrasah terdaftar dari Kepala Kantor Wilayah Departemen Agama Propinsi Daerah Istimewa Aceh. Piagam yang ditetapkan berdasarkan Keputusan Dirjen Bimas Islam Nomor: KEP/D/68/77 ini memberikan hak kepada madrasah tersebut untuk menyelenggarakan Pendidikan dan Pengajaran serta diperbolehkan untuk mengikuti Ujian Persamaan Madrasah Negeri.

2. Penegerian (MAN Indrapuri)

Dalam rangka menunjang pembangunan nasional di bidang pendidikan, pemerintah memandang perlu melaksanakan penegerian madrasah untuk dijadikan model dan pembina madrasah swasta di sekitarnya.

Peningkatan status kelembagaan terjadi pada tanggal 22 Maret 1999 melalui Keputusan Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 71 Tahun 1999 tentang Penegerian 85 Madrasah di Propinsi Daerah Istimewa Aceh. Madrasah Aliyah Swasta Indrapuri resmi dibuka dan dinegerikan menjadi Madrasah Aliyah Negeri (MAN) Indrapuri, berlokasi di Desa Pasar Indrapuri, Kec. Indrapuri, Kabupaten Aceh Besar.

3. Perubahan Nomenklatur (MAN 3 Aceh Besar)

Seiring dengan perubahan regulasi dalam tata kelola madrasah negeri di Indonesia, Kementerian Agama Republik Indonesia melalui Surat Keputusan Menteri Agama RI No. 670 Tahun 2016 tertanggal 17 November 2016, menetapkan perubahan nomenklatur madrasah negeri. Sejak saat itu, MAN Indrapuri resmi berganti nama menjadi Madrasah Aliyah Negeri 3 Aceh Besar (MAN 3 Aceh Besar).

4. Capaian Akreditasi Terbaru

Hingga saat ini, MAN 3 Aceh Besar terus berupaya meningkatkan kualitas pendidikan dan fasilitas. Komitmen ini tercermin dari capaian akreditasi terbaru, di mana MAN 3 Aceh Besar (NPSN 10114248) dinyatakan Terakreditasi A. Peringkat akreditasi ini diberikan berdasarkan Keputusan Ketua Badan Akreditasi Nasional Pendidikan Anak Usia Dini, Pendidikan Dasar, dan Pendidikan Menengah (BAN-PDM) Nomor: 195/BAN-PDM/SK/2025, yang ditetapkan pada tanggal 11 April 2025. Sertifikat Akreditasi ini berlaku hingga tanggal 31 Desember 2029.

MAN 3 Aceh Besar berlokasi di Jl. Banda Aceh – Medan KM. 24,5 SP Krueng Jreu Indrapuri, Kecamatan Indrapuri, Kabupaten Aceh Besar, Provinsi Aceh.